幾乎所有病人都表現有肝功能損害，如食欲不振、消化不良等，晚期病人甚至有惡液質現象。
由于泡球蚴在肝實質內呈彌漫性浸潤生長，并逐漸波及到整個肝，對肝組織的破壞特別嚴重，可引起肝功能衰竭而導致肝昏迷，或誘發肝硬化而引起門靜脈高壓，并發消化道大出血而死亡。
泡球蚴若侵入肝門靜脈分支，則沿血流在肝內廣泛播散，形成多發性寄生蟲結節，出現肉芽腫反應，可誘發肝硬化和膽管細胞型肝癌;侵入肝靜脈則可隨血循環轉移到肺和腦，引起相應的呼吸道和神經系統癥狀如咯血、氣胸和癲癇、偏癱等。
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