在使用微波爐加熱時，應該避免過熱和時間過長。盡量不要煮蛋類、核桃、栗子、花生、番茄或爆玉米花。因為它們有“非多孔性”的殼、皮、膜，當在高溫、高壓下，會發生內部膨脹。一旦打開爐門時，壓力會突然釋放而產生爆炸，可能造成對眼睛的損傷。如果需要煮這些食物時，應在烹飪前，將殼、皮、膜戳破，讓加熱時所產生的熱氣能跑出來，然后再放入微波爐內煮，但溫度仍不能過高。
在熱牛奶或豆漿時，更應注意控制加熱溫度和時間。因為牛奶或豆漿內的水分受到熱的作用轉化為水蒸氣時，較脂肪粒或蛋白質要快得多，因此很容易溢出鍋外。此外，如果牛奶或豆漿放在奶瓶內，水蒸氣的壓力會使橡皮奶頭爆破，隨之則將牛奶或豆漿;中灑出來而引起意外。
正確地使用微波爐，可以減少它的泄漏能量。注意在開、關爐門時應輕，旋轉調節時間和溫度的旋紐時應輕、慢，盡量少轉動。
另外，注意操作距離。在離微波爐3米處為安全區，漏能值為0。因此，微波爐應放在不常有人走動之處，放得高些，避免兒童玩弄。孕婦、老人和體弱者盡量少用或不用。在開動微波爐時，人盡量走開。
微波爐出廠時的漏能值低，但隨著時間的推移，使用次數的增多，微波爐老化，漏能值會增高。因此，應經常保持微波爐爐門的密封性。此外，切忌用眼睛直接從觀察窗處向爐內看烹飪的食物，因觀察窗處的漏能較大。
