結腸鏡檢會稍有不適一般人都可以接受，在做鏡檢前三天要注意飲食清淡，檢查的當天要禁食，在檢查之前會服用藥物排出體內的糞便，如果以前做過手術或是有腸粘連的情況會有一些脹痛，不用太緊張，可以深呼吸來減少疼痛感。
做肛腸鏡檢查的注意事項：
1、服上藥后如排出物含有糞便或糞水樣液體，應及時告訴腸鏡檢查醫護人員，以作進一步的腸道處理。
2、為了便于進鏡或看清腸腔的粘膜形態，醫生有時需要向腸腔內注入少量空氣以擴張或暴露腸腔，此時患者常感到腹脹，有解大便的感覺。
另外，由于大腸彎曲迂回，專家介紹有時腸子的彎曲角度太大，或患者有腹部手術史，腸粘連，腸鏡在通過時，患者會感到一些脹痛。這時最好作深呼吸，不要過度緊張，否則易發生腸痙攣，增加醫生進鏡的難度與風險，延長操作時間。
3、檢查平均約需要15分鐘左右，有時因個體差異，或大腸有異常情況，檢查時間可能會稍長一些。
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