手足口病和皰疹性咽頰炎這兩種疾病是會有一定的區別，對于手足口病來說癥狀就會變得更加嚴重一些，尤其是急性的患者是會讓自己的臨床表現發作起來非常急性，其中就包括了發燒、厭食等反應，不過這種疾病就算是發作比較突然，但只要經過一段時間治療以后康復速度還是非常快。
1.普通病例表現
急性起病，發熱、口痛、厭食、口腔黏膜出現散在皰疹或潰瘍，位于舌、頰黏膜及硬額等處為多，也可波及軟腭，牙齦、扁桃體和咽部。手、足、臀部、臂部、腿部出現斑丘疹，后轉為皰疹，皰疹周圍可有炎性紅暈，皰內液體較少。手足部較多，掌背面均有。皮疹數少則幾個多則幾十個。消退后不留痕跡，無色素沉著。部分病例僅表現為皮疹或皰疹性咽峽炎。多在一周內痊愈，預后良好。部分病例皮疹表現不典型，如單一部位或僅表現為斑丘疹。
2.重癥病例表現
少數病例（尤其是小于3歲者）病情進展迅速，在發病1～5天左右出現腦膜炎、腦炎（以腦干腦炎最為兇險）、腦脊髓炎、肺水腫、循環障礙等，極少數病例病情危重，可致死亡，存活病例可留有后遺癥。
（1）神經系統表現并發中樞神經系統疾病時表現：精神差、嗜睡、易驚、頭痛、嘔吐、譫妄甚至昏迷；肢體抖動，肌陣攣、眼球震顫、共濟失調、眼球運動障礙；無力或急性弛緩性麻痹；驚厥。查體可見腦膜刺激征，腱反射減弱或消失，巴氏征陽性。合并有中樞神經系統癥狀以2歲以內患兒多見。
（2）呼吸系統表現并發肺水腫表現：呼吸淺促、呼吸困難或節律改變，口唇發紺，咳嗽，咳白色、粉紅色或血性泡沫樣痰液；肺部可聞及濕啰音或痰鳴音。
（3）循環系統表現并發心肌炎表現：面色蒼灰、皮膚花紋、四肢發涼，指（趾）發紺；出冷汗；毛細血管再充盈時間延長。心率增快或減慢，脈搏淺速或減弱甚至消失；血壓升高或下降。
