睜眼困難的診斷主要依賴詳細的眼科神經學檢查，包括眼瞼下垂，眼位外斜，瞳孔擴張，兩眼協調性不佳等等癥狀，視網膜，視乳頭檢查也是一個重點，另外一個檢查的方向則是放在排除足以危害其他組織器官的疾病。因此,除了基本眼科神經學的檢查之外，我們也必須進行某些影相學檢查(電腦斷層CT，核磁共震儀MRI，血管造影，排除掉一些進行性的疾病，若是病患原先本身并無特殊的全身性疾病(諸如高血壓,糖尿病等疾病)，則要懷疑是否有腦神經血液，血管，腫瘤等疾病，也就是要排除第三對腦神經路徑上的病變，如果必要，會同神經科專家做適當的會診也是相當重要。
1.動眼神經麻痹再生錯向綜合征 動眼神經麻痹后再生紊亂時，眼外肌被再生方向錯誤的神經纖維所支配，可以伴隨各種眼球運動，有奇異的眼瞼運動表現為患眼企圖下轉或內轉時出現眼瞼退縮或瞳孔縮小，一般無自動節律改變，個別病例周期性痙攣與再生錯向合并存在多見于先天性或外傷性動眼神經麻痹的急性期或恢復期
2.Marcus-Gunn綜合征 又稱下頜瞬目綜合征，由MarcusGunn首先描述故而得名。周期性動眼神經麻痹常見于先天性上瞼下垂合并上直肌麻痹的患者，表現為先天性上瞼下垂與翼狀肌的特殊連帶運動即同側翼狀肌受刺激時患眼下垂和眼瞼退縮，這種眼瞼退縮常發生在張嘴、下頜前突咀嚼及伸舌等運動時，瞳孔無異常改變其病因可能與三叉神經分支錯向到第Ⅲ腦神經支配提上瞼肌的位置有關。
3.Marin-Amat綜合征 又稱反下頜瞬目綜合征。周期性動眼神經麻痹的特點是當張口及下頜運動時出現眼瞼下垂，閉口或停止咀嚼時上瞼下垂消失。
4.眼肌型重癥肌無力周期性動眼神經麻痹是一種累及神經-肌肉接頭處的突觸后膜乙酰膽堿受體，導致神經-肌肉間興奮傳遞障礙，具有反復復發與緩解傾向的自身免疫性疾病。表現為早期出現上瞼下垂單眼或雙眼，晨輕午后重，瞳孔括約肌受累較晚。麻痹肌的麻痹輕重程度及斜視度數變化較大常有復視，注射新斯的明或滕喜龍后上述癥狀減輕或消失。
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