1.血管疾病:椎—基底動脈供血不足常發生腦干病變癥狀,臨床上可出現意識障礙、眩暈發作、猝倒及癱瘓。
2.腫瘤:腦干的中腦部位發生腫瘤時,可出現進行性一側或雙側動眼神經麻痹。中腦腫瘤時,容易出現嗜睡、昏睡、甚至昏迷。腫瘤局限在腦橋并損傷了雙側皮質腦干束時,可出現假性延髓麻痹及中樞性舌下神經癱瘓等癥狀。
3.外傷:頭部受到打擊或身體其他部位受到撞擊后常腦干撞在小腦幕裂孔的邊緣或枕骨的斜坡上。或使沿腦干縱軸向下強烈移動而造成腦干的損傷。
4.炎癥:腦干炎可出現腦干彌漫性水腫及脫鞘性改變,神經膠質細胞增生,神經細胞輕度改變。