肺曲霉球的最常見癥狀是咯血，發生率50%～90%，咯血量亦多變化，從很少量到大量致死性咯血不等。咯血原因有幾種假設，如隨呼吸運動曲霉球對血管的機械性摩擦與損傷，曲霉內毒素所致溶血作用與抗凝作用。空洞壁血管的局部性侵蝕可能也是一種參與因素。其他常見癥狀有慢性咳嗽。偶有體重減輕。除非合并細菌性感染，患者一般無發熱。毗鄰胸膜的曲霉球可以引起胸膜腔感染，個別病例可導致支氣管胸膜瘺。部分患者呈現隱匿性過程，持續多年無癥狀，但絕大多數最終出現癥狀。曲霉球本身很少有體征，依基礎疾病的范圍、性質和部位不同，可以發現相應體征。
典型X線征象對肺曲霉球具有很高診斷價值。另一方面，隱源性咯血而X線無確定病變發現者也應考慮到本病可能。影像學上曲霉球具有特征性征象，但需要與其他真菌球、空腔化錯構瘤、肺癌、肺膿腫和棘球蚴囊腫等相鑒別。
痰培養可以確認曲霉的存在，但陽性率不高。纖支鏡檢查包括防污染技術采集下呼吸道標本、支氣管肺泡灌洗及經支氣管肺活檢(病灶)可以提高曲霉球診斷的敏感性和特異性，有助于與其他真菌球或肺球形病灶相鑒別。活檢時應在影像學監視下對準曲霉球，不要損傷洞壁，以防出血。合并胸膜病變者亦可采用胸膜活檢。
血清免疫學檢查對診斷有幫助。血清沉淀者抗體陽性率幾近100%，對X線可疑曲霉球患者的鑒別診斷具有很高敏感性和特異性。皮膚試驗在曲霉球的陽性率僅22%，顯著低于ABPA(陽性率99%)。
