傳染性軟疣病的組織病理學特征是表皮明顯增生，表皮突向下延伸并被結締組織包裹形成梨狀囊體，在棘層細胞胞漿內有稱為軟疣小體的病毒包涵體。
尖銳濕疣實驗室檢查
1.醋白試驗：用5%醋酸液涂抹皮損處，3—5分鐘后變白色。(十分實用而簡便的辦法)
2.碘黃試驗：用魯戈氏液涂后3分鐘，發黃者可以確診為尖銳濕疣。
3.皮損活檢：發現有HPV感染的特征性凹空細胞的組織病理變化特點。(較可靠的辦法)
4.必要時在皮損活檢中用抗原或核酸檢測顯示有HPV感染。常見的是HPPV6、11型。目前多應用快速敏感及特異性很高的聚合酶鏈式反應，陽性率可達80%左右。當真性和假性尖銳濕疣鑒別困難時，可用HPV-DNA原位分子雜交進行鑒別，此法是目前一種敏感性和特異性很高的鑒別手段，陽性率可高達90%以上。
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