本病須與風濕病、多發性骨疣、纖維織化肌炎、皮肌炎、泛發性鈣化等病鑒別。風濕熱多涉及關節，軟組織內無鈣化。多發性骨疣患者運動無障礙，用X線檢查易于鑒別。纖維織化肌炎不存在骨性組織。皮肌炎的皮膚癥狀一般都顯著，開始先侵犯肢體，后來涉及軀干，皮膚及其下面的肌肉常有炎癥表現，局部可有觸痛性硬結，肌肉和皮下脂肪的壞死灶可以鈣化。泛發性鈣化病不限于肌肉，肢體內病變更多。
骨化性肌炎應與血腫鈣化、間質性鈣質沉著癥和成骨肉瘤鑒別。骨化性肌炎的鈣化部位在骨干，與骨表面平行，其間有清楚的正常骨皮質和骨膜。相反，成骨肉瘤總有皮質和骨膜破壞的跡象，病變位于干骺端。對可疑的病例，短期內連續X線照片有助于鑒別診斷。個別病例組織學檢查仍有可能誤診。
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