艾滋病并發癥中多系統受累者達86.6%，以消化、呼吸、血液和淋巴系統為主。并發癥依次為細菌性肺炎、口腔毛狀粘膜白斑、鵝口瘡、各種感染性腹瀉、貧血和消耗綜合癥。機會性感染占所有并發癥的80.6%。我國AIDS并發癥和機會性感染病原體與國外報告相差較大，應結合實際有針對性地預防和及時治療并發癥。
1.機會性感染
(1)原蟲感染
A)弓形體病
常有頭痛、發熱、腦膜腦炎、視網膜脈絡膜炎等，診斷主要靠檢測血中抗弓形體IgM抗體( )或頭顱CT見典型環圈狀病變。該病是由寄生性原蟲動物鼠弓漿蟲所致的一種動物傳染病。先天性感染是由母親經胎盤傳給胎兒。后天性感染是因吃了含有組織囊蟲的生肉或未煮熟的肉而感染。
B)隱孢子蟲腸炎
孢子蟲是寄生于家畜和野生動物的小原蟲，人感染后，附于小腸和大腸上皮，主要引起吸收不良性腹瀉，病人表現為難以控制的大量水樣便，每日5～10次以上，每天失水3～10升，病死率可高達50%以上。診斷靠腸鏡活檢或糞便中查到原蟲的卵囊。
C)卡氏肺囊蟲性肺炎
主要發生于肺部，可導致呼吸困難、持續的咳嗽，發熱等。卡氏肺囊蟲是一種專在人的肺內造穴打洞的小原蟲。健康人在感染艾滋病毒后，免疫功能受到破壞，這時卡氏肺囊蟲便乘虛而入，在病人體內大量繁殖，使肺泡中充滿滲出液和各種形態的肺囊蟲，造成肺部的嚴重破壞。
據對180例卡氏肺囊蟲肺炎X線胸片檢查所見，表現為兩側間質性肺炎的77例，間質及肺泡炎癥45例，肺門周圍的間質炎癥26例，單側肺泡及間質炎癥24例，未見異常者8例。肺功能測定示肺總量及肺活量下降，隨著病程的進展而進一步加劇。氣管鏡或肺穿刺所取之標本可以查到卡氏肺囊蟲，有時還可以查到其它病原體，此時為混合性機會感染。本病病程急劇，亦可緩慢，終因進行性呼吸困難、缺氧、發展為呼吸衰竭而死亡，其病死率可達90%～100%。
(2)細菌性感染
最多見的是結核桿菌和鳥型分支桿菌，肺結核進展很快，可見空洞和痰菌陽性，治療較困難亦有全身播散性結核。
A)分歧桿菌感染
可以感染體內幾乎所有的器官，導致一些非特異性的癥狀如發熱、夜間多汗、體重下降、胃痛以及腹瀉等。確診主要靠病原分離培養及活檢。
B)沙門菌感染
其引起的癥狀有：嚴重的腹瀉、發熱、寒戰、腹痛以及偶爾的嘔吐等。
C)桿菌性血管瘤病
由血管增生引起，表現為皮膚或其它器官的腫瘤樣腫塊。
D)結核桿菌感染
結核病常發生于有病毒感染但尚未發展成艾滋病的病人，可能是因為結核桿菌的毒力強于其它與艾滋病相關的病原體，如卡氏肺囊蟲等，所以結核病更易發生于免疫缺陷早期。74%～100%的艾滋病感染伴結核病人有肺結核，其癥狀和體征常難以鑒別于其他相關的肺部疾病。最突出臨床特征是高發肺外結核，最常見的形式為淋巴結炎和粟粒性病變，常波及骨髓、泌尿生殖道和中樞神經系統。
E)細菌性肺炎
F)其他
如綠膿桿菌、大腸桿菌、傷寒桿菌、淋球菌等的感染。
(3)真菌感染
A)口腔念珠菌感染
白色念珠菌是一種條件致病真菌，存在于正常人的皮膚、口腔、上呼吸道、腸道和陰道粘膜上，可從皮膚和粘膜分泌物、大小便、痰液中培養出來。當人體抵抗力降低或機體菌群失調時，可使白色念珠菌變為致病菌導致感染。可分為皮膚念珠菌病和粘膜念珠菌病，后者多見為鵝口瘡：口腔粘膜、舌及咽喉、齒齦或唇粘膜上的乳白色薄膜，易剝離，露出鮮濕紅潤基底。如果同性戀者持續有鵝口瘡且無其他原因解釋時，往往表明患者已感染了艾滋病毒或將發展為艾滋病。念珠菌性食道炎可造成吞咽困難及疼痛或胸骨后疼痛，食道鏡檢查可見食道粘膜有不規則潰瘍和白色偽膜。其它尚有念球菌性口角炎、念珠菌性陰道炎、念珠菌性龜頭包皮炎、內臟念珠菌病等。診斷有賴于臨床表現和真菌檢查。
B)隱球菌腦膜炎
可以出現頭痛、高熱、頸部僵硬、對光線過于敏感等癥狀。是由新型隱球菌感染引起的一種急性或慢性深部真菌病。當機體抵抗力減弱時，容易經呼吸道，偶可經腸道或皮膚入侵致病。隱球菌腦膜炎是艾滋病常見的并發癥，有很高的病死率，表現為發熱、頭痛、精神錯亂及腦膜刺激癥狀。肺部隱球菌，以亞急性或慢性發病，伴咳嗽、粘痰、低熱、胸痛、乏力、X線檢查為非特異性改變。對隱球菌病的診斷主要依據臨床表現和真菌檢查確診。
(4)病毒性感染
可見乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、單純皰疹病毒(HSV)、帶狀皰疹病毒(HZV)、巨細胞病毒(CMV)和EB病毒等感染。
A)巨細胞病毒感染
可破壞眼睛(可能致盲)、消化系統、肺或其他器官。多數巨細胞病毒感染者無癥狀，但可在尿、唾液、糞便、眼淚、乳汁和精液中遷延排出病毒，并可經輸血、母親胎盤、器官移植、性交、吮哺母乳等方式傳播。艾滋病伴巨細胞病毒感染時，常表現為肝炎、巨細胞病毒肺炎、巨細胞病毒性視網膜炎、血小板和白細胞減少、皮疹等。確診必需在活檢或尸解標本中找到包涵體或分離出病毒。
B)病毒性肝炎
包括甲肝、乙肝和丙肝。
C)人類乳頭狀病毒感染
明顯增加婦女得宮頸癌的風險。
D)進行性多灶性白質腦病
腦部感染性疾病。癥狀有：言語困難，身體的某一側出現虛弱，視力喪失，上下肢的麻木感等。
E)單純皰疹病毒感染
導致生殖器皰疹。其傳播途徑主要是直接接觸和性接觸，也可經飛沫傳染，病毒可由呼吸道、口、眼、生殖器粘膜或破報皮膚侵入人體。孕婦在分娩時亦可傳給嬰兒。感染病毒后可引起艾滋病患者皮膚粘膜損害、累及口周、外陰、肛周、手背或食道以至支氣管及腸道粘膜等，以唇緣、口角的單純皰疹最常見，其損害呈高密集成群的小水皰，基底稍紅，水皰被擦破后可形成潰瘍，其潰瘍特點為大而深且有疼痛，常伴繼發感染，癥狀多較嚴重，病程持續時間長，病損部位可培養出單純皰疹病毒，活檢可查到典型的包涵體。
F)EB病毒
該病毒在艾滋病人中感染率很高，有96%的艾滋病人血清中可檢測到EB病毒抗體，EB病毒可致原發性單核細胞增多癥，伴溶血性貧血、淋巴結腫大、全身斑疹，T細胞減少等。
2.惡性腫瘤
(1)卡波濟肉瘤
在皮膚或黏膜上包括肺和食道胃腸均可見，診斷需靠活檢做病理檢查。
(2)淋巴瘤
常有持續發熱，全身淋巴結腫大，診斷靠活檢送病理。
(3)非霍奇金淋巴瘤
發生于淋巴細胞，艾滋病毒感染后患此癌癥的風險增高。
3.常見營養不良
由于各種感染或腫瘤消耗過多，而患者又食欲減退，時間長會造成營養不良甚至惡液質。
