膽道蛔蟲癥的并發癥主要有下列幾種：
1.膽道感染 多為大腸埃希菌感染。患兒發熱，右上腹壓痛緊張范圍擴大，且持續存在，有時于右季肋下能摸到腫大疼痛膽囊。末梢血象白細胞增高。
2.膽道壞死 原來的陣發性劇痛減輕，但劍突及右季肋下壓痛區擴大，并出現腹肌緊張。如有壞死穿孔，則肌緊張范圍更擴大至左上腹或右下腹，發生膽汁性腹膜炎時，出現全腹膨脹，肌緊張，并有時出現休克。
3.肝炎和肝膿腫 蛔蟲引起的肝炎表現為肝大并有壓痛、高熱、白細胞增高以及轉氨酶上升。膿腫形成時，原有的陣發性劇痛消失，而以高熱、肝大及壓痛為主要癥狀。肝臟超聲波檢查可測知單一或多發膿腫。有時肝膿腫破入膈下或胸腔，出現膈下膿腫或膿胸。
4.胰腺炎 由于膽道出口括約肌痙攣及蛔蟲堵塞膽道出口，使胰液反流而發生急性胰腺炎，左上腹有壓痛和腹肌緊張。血及尿淀粉酶增高。
5.肝臟、膽道出血 蛔蟲上行入肝內小膽管，因嚴重感染可導致肝或膽道出血，經消化道排出，表現為大量血便，嘔吐咖啡樣物或嘔血。
6.膽石癥 膽道內蛔蟲卵或蛔蟲殘體都可成為核心，形成結石，是膽道蛔蟲的后遺癥。在兒童期很少見。
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