(1)組織細胞增殖癥可合并肺內病變，后者也可單獨發生。肺內開始為間質性肉芽腫，隨后組織細胞侵入小動脈和細支氣管遠端，發生阻塞性肺氣腫，形成囊腫和大泡以致破裂。肺間質性肉芽腫內有許多嗜酸性粒細胞、中性粒細胞及淋巴細胞浸潤。
(2)運動系統并發癥：可能發現顱骨、肋骨局部有腫塊、壓痛，病理性骨折或畸形。伴有股骨病變者，多有跛行。脊椎骨原發性嗜酸性肉芽腫偶有因為壓迫脊髓引起癱瘓。
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