診斷需根據具體情況，下面以肛裂為例：
肛裂癥狀有明確特點，只要詳細訊問病史病程，以及疼痛、出血特點，診斷并不困難。但在診斷時，為了提高診斷的準確性，防止失誤，應嚴格按問診、觸診、視診及活體組織檢驗幾個方面加以鑒別診斷。
視診：急性肛裂肛門部可見分泌物，牽開臀部可見肛裂下端，如用探針輕觸裂口的下端，可引起疼痛;慢性肛裂常見有結締組織外痔。
指診：因括約肌痙攣肛門收緊，如用力過猛，常引起劇烈疼痛，有時須在局麻下檢查。肛門內摸到的裂口，急性者邊緣軟，底淺，有彈性，觸之敏感;慢性者邊硬突起，底深，無彈性。
窺器檢查：可見卵圓形潰瘍，或見細小裂口。急性肛裂的裂口邊緣整齊，底淺紅色;慢性肛裂的裂口邊緣不整齊，底深灰白色，有的嚴重肛裂者還可看到括約肌纖維。
鑒別診斷：須與結核性潰瘍、梅毒潰瘍、軟下疳和上皮癌等潰瘍相鑒別。其中潰瘍性結腸炎和肉芽腫性結腸炎并發之肛裂極易鑒別。
痔瘡和肛裂的區別
肛裂多數伴有哨兵痔，特別是被長期忽視肛裂病癥的患者，發展為陳舊性肛裂后，常同時伴有外痔、內痔，這時兩者在肛門外的表征基本相同。所以，了解肛裂和痔瘡的區別，提高肛腸異常的警惕意識對治療大有裨益。
肛裂是以肛管皮膚裂口，肛管潰瘍，難以愈合為主要表現。痔瘡則是由于肛門周圍靜脈形成靜脈曲張、靜脈血管團，以及直腸下端粘膜滑動而形成的。
1.肛裂以疼痛、便血為主。痔瘡以出血為主，只有外痔發炎腫脹時，痔瘡才會劇痛。
2.肛裂可見肛管皮膚裂開，而痔瘡則無。在肛門指診時，即可確定，但肛裂者多不可行肛門指診，或者窺器檢查;
3.肛裂多伴有肛乳頭肥大、肛乳頭瘤，而痔瘡則不伴有肛乳頭肥大或乳頭瘤;
4.肛裂者，肛門外觀可見狹窄，而痔瘡患者則多見內痔脫出、外翻。
有按時排便的規律，無久蹲強努的不良習慣。
