腹瀉的原發疾病或病因診斷主要須從病史、癥狀、體征、常規化驗特別是糞便檢驗中獲得依據。許多病例通過仔細分析病史和上述檢查的初步結果，往往可以得出正確診斷。如診斷仍不清楚，可進一步作X線鋇灌腸和鋇餐檢查，和(或)直、結腸鏡檢查。如仍無明確結論，則須根據不同情況選用超聲、CT、內鏡逆行膽胰管造影(ERCP)等影象診斷方法以檢查膽、胰疾病，或進行小腸吸收功能試驗、呼氣試驗、小腸粘膜活檢以檢查小腸吸收不良。高度懷疑腸結核、腸阿米巴病等有特效治療的疾病，經過努力都不能確診時，可在一定限期內進行治療試驗。
1.嬰糼兒急疹：多見于1歲以下的小兒，6個月以下的小兒更多見，皮疹出現前常有發熱，有些伴有腹瀉，但這種腹瀉經過治療易緩解，皮疹出現后，腹瀉癥狀和發熱一樣，也消失了。
2.胃腸型感冒：多見于挑食的小兒，這樣的小兒看上去就是有點消瘦，舌苔也常有地圖舌和花
剝苔，如果仔細問病史，家長會告訴你，以前發熱感冒都會嘔吐和腹瀉，胃腸型感冒，以嘔吐癥狀較常見，腹瀉較輕，常不被重視。
3.細菌性腸炎，尤其是侵襲性腸炎早期，在膿血便出現之前，可以僅有嘔吐或稀便，有些有輕度發熱，此時就診，極易誤診，常是治療后不久家長又來找你了：小孩又發熱了，拉膿血便了，有腹痛了。總的來說：鑒別診斷也有取巧的辦法：對于鑒別細菌性和病毒性腹瀉，年齡是個關鍵，一般1歲以下的小兒，以母乳和奶粉喂養為主，接觸污染食物的機會不大，所以以病毒性腹瀉多見。而年長兒童，進食種類復雜，較易食入細菌污染的食物，尤其是夏秋季，以細菌性腹瀉為主。
腹瀉的治療
腹瀉是癥狀，根本治療要針對病因。認識腹瀉的發病機理有助于掌握治療原則。
(一)病因治療 不言而喻，腸道感染引起的腹瀉必需抗感染治療，以針對病原體的抗菌治療最為理想。復方新諾明、氟哌酸(諾氟沙星)、環丙氟哌酸(環丙沙星)、氟嗪酸(氧氟沙星)對菌痢，沙門菌或產毒性大腸桿菌，螺桿菌感染有效，甲硝唑對溶組織阿米巴、梨形鞭毛蟲感染有效，因此，這數種藥物常用于急性感染性腹瀉，包括預防和治療所謂旅行者腹瀉。治療乳糖不耐受癥和麥膠性乳糜瀉所致的腹瀉在飲食中分別剔除乳糖或麥膠類成發。高滲性腹瀉的的治療原則是停食或停用造成高滲的食物或藥物。分泌性腹瀉易致嚴重脫水和電解質丟失，除消除病因，還應積極由口服和靜脈補充鹽類和葡萄糖溶液，糾正脫水。膽鹽重吸收障礙引起的結腸腹瀉可用消膽胺吸附膽汁酸而止瀉。治療膽汁酸缺乏所致的脂肪瀉，可用中鏈脂肪代替日常食用的長鏈脂肪，因前者不需經結合膽鹽水解和微膠粒形成等過程而直接經門靜脈系統吸收。
(二)對癥治療 選擇藥物時，應避免成癮性藥物，必要時也只能短暫使用。病因治療是主要的，凡病因不明者，盡管經對癥治療后癥狀已有好轉，絕不可放松或取消應有的檢查步驟，對尚未排除惡性疾病的病例尤其如此。
1.止瀉藥 常用的有活性炭、鞣酸蛋白、次碳酸鉍、氫氧化鋁凝膠等，日服3～4次。藥效較強的復方樟腦酊(3～5ml)和可待因(0.03g)，每日2～3次。因久用可成癮，故只短期適用于腹瀉過頻的病倒。復方苯乙哌酊(每片含苯乙哌啶2.5mg和阿托品0.025mg)，每次1～2片，2～4/d，此藥有加強中樞抑制的作用，不宜與巴比妥類、阿片類藥物合用。氯苯哌酰胺(咯派丁胺，loperamide)的藥效較復方苯乙哌啶更強且持久，不含阿托品，較少中樞反應。初服4mg，以后調整劑量至大便次數減至1～2次/d，日量不宜超過8mg。培菲康可調節腸道功能。
2.解痙止痛劑 可選用阿托品、普魯本辛、山莨菪堿、普魯卡因等藥。
3.鎮靜藥 可選用安定、利眠寧、苯巴比妥類藥物。
4.調節腸道植物神經紊亂藥可選解郁抗慮膠囊等藥物。
(三)考慮到吃西藥副作用很大，可以考慮服用“永倉訶苓止瀉膠囊”進行治療。優點是中藥制劑沒有毒副作用，治療效果比較理想，缺點是服用時間比較長一般的患者都需要按療程進行服用。
(四)蒙脫石散
抗生素、微生態、中成藥等方法的治療都會或多或少的具有毒性，可能傷害到腸道內的健康菌群。而新型治療藥物蒙脫石散，可以利用蒙脫石的層紋狀結構及非均勻性電荷分布，對消化道內的病毒、病菌及其產生的毒素有固定、一直作用對消化道粘膜有覆蓋能力，并通過與粘液糖蛋白相互結合，從質和量兩方面修復、提高粘膜屏障對攻擊因子的防御功能。并且藥物成分不進入血液循環系統，并連同所固定的供給因子隨消化道自身蠕動排出體外。不改變正常的腸蠕動。可選擇藥物：司邁特蒙脫石散(3g成人兒童裝、1g嬰幼兒裝)。
