菏澤市傳染病醫(yī)院（菏澤市第五人民醫(yī)院）隸屬于菏澤市衛(wèi)生健康委員會，主要業(yè)務(wù)范圍為結(jié)核病、肝病、手足口病、性病、艾滋病等傳染病的醫(yī)療與護(hù)理，為人民身體健康提供醫(yī)療與護(hù)理保健服務(wù)。

醫(yī)院始建于1953年，2003年7月，菏澤市委、市政府為加強菏澤市傳染病救治工作，在原結(jié)核病醫(yī)院的基礎(chǔ)上改擴(kuò)建為菏澤市傳染病醫(yī)院，為公益一類事業(yè)單位，是菏澤市委、市政府和市衛(wèi)生健康委員會指定的全市傳染病重癥救治定點醫(yī)院，是菏澤市傳染病重癥救治中心。

醫(yī)院占地46.3畝，總建筑面積12000余平方米，開放床位200張。現(xiàn)有在職職工185人，其中正高8人，副高26人。醫(yī)院圍繞傳染病專業(yè)體系，重點打造結(jié)核病、肝病、感染性疾病等重點專業(yè)，設(shè)置了結(jié)核科、肝病科、感染性疾病科等特色臨床科室，醫(yī)院還設(shè)置了放射科、CT室、檢驗科、特檢科等診斷輔助科室。

醫(yī)院設(shè)有負(fù)壓病房、PCR實驗室，擁有GE64排螺旋CT、數(shù)字胃腸機、DR機、移動X光機、全自動生化分析儀、血氣分析儀、核酸自動提取儀、實時熒光PCR儀，電子胃鏡、纖維支氣管鏡、心腹兩用彩超、腦彩超、血液濾過機、人工心肺機、高檔呼吸機等一批先進(jìn)的醫(yī)療設(shè)備，為開展醫(yī)療科研提供了保障。

醫(yī)院與北京佑安醫(yī)院、山東省胸科醫(yī)院結(jié)為友好合作醫(yī)院，是中國結(jié)核病臨床實驗合作中心、全國結(jié)核病醫(yī)院聯(lián)盟、北京結(jié)核病診療技術(shù)創(chuàng)新聯(lián)盟、山東省心肺專科醫(yī)聯(lián)體成員單位，是山東省感染性疾病專科聯(lián)盟理事單位。

在2003年抗擊SARS、2009年救治手足口病和甲型H1N1流感中，醫(yī)院都臨危受命，沖鋒在前。曾榮獲“全國結(jié)核病防治工作先進(jìn)單位”、“全省無償獻(xiàn)血工作先進(jìn)集體”、“山東省誠信醫(yī)療衛(wèi)生單位”、“全國百姓放心傳染病專科示范醫(yī)院”、“全國誠信示范醫(yī)院”、山東省“富民興魯勞動獎狀”、山東省“全省結(jié)核病防治工作先進(jìn)集體”等榮譽稱號，2009年榮獲菏澤市“手足口病救治先進(jìn)集體”并被市委、市政府授予集體“二等功”。