位于新址長春市朝陽區清華路1500號的吉林大學口腔醫院是原白求恩醫科大學與吉林大學等六校合并后于2000年命名的，始建于1985年，是國家教育部所屬、衛生部直管的一所專科醫（學）院，是吉林省及鄰近地區口腔醫學教育、科研和口腔病防治中心，吉林省及臨近地區唯一的口腔醫學一級學科博士學位授權點和博士后流動站。現為吉林省牙病防治指定的常務辦公機構。

醫院設有牙體牙髓病科、兒童口腔科、口腔粘膜病科、牙周病科、口腔頜面外科、口腔種植中心、口腔修復科、口腔正畸科、預防保健科、VIP特診科、急診科、綜合科、麻醉科等臨床科室，口腔放射線科、供應室、藥劑科、檢驗科、輸血科、理療室、義齒制作中心、口腔病理室、手術室等醫技科室，院長辦公室、黨務辦公室、學生工作辦公室、醫保辦公室、財務部、醫務部、科教部、護理部、醫院感染控制辦公室、后勤服務部、物資供應部、人力資源部、保衛部等行政科室。

醫院現有教職員工340人。其中博士生導師5人，碩士生導師34人。教授18人，副教授34人。不但竭誠為廣大口腔病患者診療服務，而且完成了五年制本科生、七年制本碩連讀碩士博士研究生、韓國留學生和專升本成人教育的教學任務。這批優秀的團隊，還承擔了國家級科研項目9項，省部、廳級科研項目共111項。作為全國口腔醫學專業教材評審委員會單位，參編了《口腔組織病理學》、《口腔正畸學》和《口腔材料學》等全國統編教材，還與兄弟院校合辦了《口腔醫學研究》和《中國口腔實用雜志》。現占居了中華口腔醫學會、中國口腔信息網絡成員等組織重要席位。

醫院先后被評為吉林省及長春市精神文明先進單位，并在長春市28家醫院社會評議監督中，以總分第一名的成績被評為“優勝單位”，并在全省 “金杯紅旗”競賽中被評為“最佳單位”，在全市“白求恩杯”競賽中連年達標，被評為“優勝單位”。醫院現為“中華口腔醫學會”、“全國口腔醫學專業教材評審委員會”、“中華醫院管理學會”、“中國口腔信息網絡”等機構的成員單位。作為吉林省口腔專科等級評審標準制定的牽頭單位，在2001年和2008年分別被確立為吉林省醫保和長春市醫保定點醫院，2006年被確立為首批新農合定點醫院。

新醫療樓建筑面積3.5萬平方米，目前為東北地區規模最大、儀器設備最先進、以博士團隊為主的醫技人才力量最雄厚的口腔疾病預防、診療和口腔醫學教育中心。醫院擁有180臺高檔牙科綜合治療機、根管治療儀、根管治療顯微鏡、血氣分析儀、纖維外科手術器械、超聲骨刀、高頻離心鑄造機、牙種植機、數字化全景X線機、三維CT機等先進儀器設備。

醫院在面向國際化進程中，積極開展以現代根管治療技術、種植義齒新技術、頜面外科腫瘤生物膜修補技術、精密附著體、直絲弓矯治術為代表的新技術、新療法，取得較好的經濟效益和社會效益。先后與日本東京醫科齒科大學醫學部、韓國延世大學締結了姊妹校關系，與美國哥倫比亞大學合作建立了口腔種植中心。

醫院在人性化服務的道路上，堅持黨的教育方針，面向現代化、面向世界、面向未來，培養德、智、體全面發展，具有創新精神和口腔醫學理論知識與臨床實際工作能力，適應新時期社會發展需要的高級口腔醫學專業人才。醫院始終把發展作為第一要務，堅持一切以病人為中心、以人為本的理念，樹立科學發展觀，領悟市場經濟的時代特征，深刻認識“競爭中求生存，生存中求發展”的嚴峻形勢，弘揚拼搏創新精神，強化 “院有特色、科有特點、人有特長”的內部發展定位，展示‘醫術精湛、服務親情、環境優美、收費合理、設施達標和管理人性”的外部社會形象。為建設一所東北地區領先、國內知名和國際上有影響的、和諧的口腔醫（學）院而不斷努力。