醫院始創于1948年，前身為中國紅十字會青浦分會醫院，2002年1月冠名為復旦大學附屬中山醫院青浦分院、上海市青浦區中心醫院。1995年被世界衛生組織（WHO）認定為愛嬰醫院，1998年起連續七屆被評為上海市文明單位，2003年被指定為青浦區臺胞臺商定點醫院。2008年，在新一輪上海市區域衛生規劃項目中被納入郊區三級醫院建設單位之一，2012年底圓滿完成了三級醫院等級評審工作。
醫院總占地面積10.48萬㎡，建筑面積11.5萬㎡，二期擴建工程于2013年內啟用，屆時開放床位將由現在的735張提升至1030張。醫院現有職工1331人，其中衛技人員1124名，衛技高級職稱83人，醫、護中級職稱438人，博士及碩士學歷研究生116名。2012年，醫院門急診量突破135萬人次，年出院病人2.8萬人次，手術10930臺。
醫院擁有先進的醫療設備，包括磁共振成像系統、血管造影X射線系統（DSA）、64排全身X射線計算機斷層掃描系統、16排多層螺旋CT機、超聲氣壓彈道碎石機、數字化彩色多普勒超聲診斷儀、高清電子腹腔鏡系統、手術內窺鏡系統（腹腔鏡.胸腔鏡.前列腺汽化電切鏡）、電子支氣管內窺鏡系統、中央監護系統、全自動微生物鑒定及藥敏分析系統、全自動化學發光儀、全自動生化分析儀、尿動力學檢查系統、麻醉系統、中型10/4高壓氧艙等設備。
醫院開設有27個臨床科室、7個醫技科室和20個病區。臨床科室設有心內科、呼吸內科、腎內科、神經內科、內分泌科、血液科、消化內科、神經外科、普外科、胸外科、骨科、泌尿外科、婦科、產科、兒科、急診ICU科、麻醉科、中醫科、耳鼻咽喉科、腫瘤科、眼科、口腔科、皮膚科、康復科和感染疾病科等；臨床科室配置產科胎兒監護室、血透室、手術室、急救室和特需病房等；醫技科室設有放射科（普放、CT室、MRI室）、藥劑科、檢驗科、超聲診斷科、高壓氧艙綜合科等。目前，醫院擁有創傷骨科、急診科和產科3個上海市醫學重點學科，微創外科、泌尿外科、呼吸內科和放射科等8個青浦區領先（重點）專科。
近年來，醫院在科教研建設上進步顯著，科研水平得到了大力提升。其中在研市科委課題2項，市科委白玉蘭科技人才基金1項，省部級課題1項。市衛生局課題17項，區在研課題80余項，榮獲區科技進步獎12項，授權實用新型專利9項。2012年度共發表論文190篇，其中核心期刊66篇，SCI論文3篇。醫院現已成為復旦大學上海醫學院、蚌埠醫學院、南通大學醫學院教學醫院，20余位高級職稱醫師被聘為兼職教授。醫院為上海市全科醫師規范化培訓基地，復旦大學上海醫學院五年制臨床專業實習基地，上海市急診專業護士實訓基地，青浦區全科醫師臨床技能培訓實習基地，神經內科、普外科、泌尿外科、骨科、急診科成為市級住院醫師規范化培訓教學基地。
