南京市高淳人民醫院始建于1936年，經過七十余年的艱苦創業，目前已成為本地區規模**、功能齊全、優勢突出，集醫療、教學、科研、急救、預防保健于一體的綜合性二級甲等醫院，是衛生部臨床路徑推進定點醫院、南京市“基本現代化醫院”、江蘇省和南京市文明單位、江蘇省首批“實施患者安全目標合格醫院”、全國院務公開示范點。
醫院核定床位820張，實際開放床位1100張，年門診量達75萬多人次，年出院4萬人次，手術1.5萬多人次。配備有瓦里安直線加速器、1.5T磁共振、64排螺旋CT、大型DSA、乳房鉬靶X光機等一大批先進醫療設備，建有虛擬化技術局域網系統，信息化建設和管理處于全省同級醫院領先地位。近年，醫院學科建設不斷發展壯大，婦產科、急診科、重癥醫學科、神經內科、神經外科、眼科、病理科、醫學影像科(超聲)、腫瘤科、耳鼻咽喉科、普外科 、麻醉科、檢驗科、醫學影像科(放射)等14個專科是南京市重點專科，腎內科、皮膚科、骨科、內分泌科、腫瘤內科等一批特色專科在高淳及周邊地區享有盛譽。
2012年2月，位于高淳經濟開發區，占地138.7畝的新區醫院一期工程竣工驗收并正式啟用，首批開放床位400張。新區醫院按照“三級醫院”標準建設，設有溫馨現代的產科病房、VIP產房，國際標準的新生兒監護病房(NICU)等，已遷入科室有：泌尿外科、腎內科、腫瘤外科、腫瘤內科、骨科、產科、血液透析室、急診科以及放射科、檢驗科、超聲科等醫技科室。2014年1月，二期工程竣工驗收并正式啟用，目前開設康復醫學科、感染性疾病科。2014年10月腫瘤放療中心正式啟用，醫院整合人力、技術等資源，按一院二區管理模式，對老區和新區醫院進行一體化運作。
醫院是江蘇建康職業學院附屬醫院，南京醫科大學、江蘇大學的教學醫院，江蘇省老科技工作者協會衛生分會技術合作醫院。同時，醫院與第三軍醫大學大坪醫院、南京鼓樓醫院、江蘇省人民醫院，以及美國Adoocat集團霍普金斯兒童醫院、意大利都靈BOSCO醫院等國內、國際一流醫院建立了技術合作關系。醫院于2005年通過ISO9001質量管理體系的認證，曾連續十五年蟬聯南京市“白求恩杯”競賽第一名，多次獲南京市“醫院管理年”活動第一名，2014年12月，醫院再次高分通過南京市二級甲等醫院復審。
