子洲縣中醫院位于縣城中心大理路33號,是縣內唯一一所中西醫結合的綜合醫院。總建筑面積15000平方米,現有職工204人,專業技術人員170人,其中高級技術職稱13人,中級職稱26人。開放床位200張,有行政、后勤、醫技、臨床科室30余個,婦科、兒科、內科、外科、肛腸科、中醫科診療居同級醫院領先水平。2015年門診人次63272,住院7339人次。醫院配有層流標準手術室,中心供氧,中心呼叫系統;自動中藥顆粒機實現了智能化抓藥,2015年與省殘聯合作,成立了南六縣殘疾人康復中心。
現有東芝螺旋CT、數字化X線攝影系統(DR)、德國狼牌腹腔鏡及全自動生化分析儀、碳14幽門螺旋桿菌檢測儀、骨密度檢測儀等先進醫療設備,并與金域公司外送可完成全部化驗項目(腫瘤系列、激素系列等)達到市級醫院同等水平。