福建醫科大學附屬口腔醫院建院基礎為1984年成立的福建醫學院口腔醫學系，前身為1986年設立的福建醫學院附屬口腔醫院門診部。自1997年12月開診后，經過艱苦創業、開拓奮進，現已成為福建省口腔醫療、教學、科研、預防中心。2014年增加冠名福建省口腔醫院。醫院座落在福州市鼓樓區楊橋中路246號，占地面積5724.12㎡，建筑面積7179.94㎡。現有4個外設門診部 (交通路門診部、晉江門診部、連江門診部、省人民醫院口腔門診部)。

醫院科室門類齊全：設有牙體牙髓科、牙周科、黏膜科、兒童牙科、口腔預防科、口腔頜面外科(包括門診、病房、整形美容等)、種植科、口腔修復科、口腔正畸科、急診綜合科、特診科、交通路門診部等臨床診療科室，其中牙周病學是衛生部國家臨床重點專科。口腔種植科、牙周病科為福建省醫學重點專科;科室配備有國內一流的牙科綜合治療椅和先進的口腔診療設備、材料。全方位提供口腔健康的預防、保健、診療等服務。

醫院專業技術力量雄厚。現有醫護員工371人，臨床醫師中93.1%的人員為大學本科以上畢業，具有博士碩士學位人員占醫師數的67.5%。在專業技術人才隊伍中，獲國務院政府特殊津貼2人、入選福建省百千萬人才工程3人，多名專家分別當選全國高校口腔醫學專業教學指導委員會委員、國際牙醫師學院院士、中華口腔醫學會各學科專業委員會副主任委員、常委、委員。

堅實的人才基礎為醫院奠定了滿足人民群眾口腔健康需求的重要條件。醫院堅持以人為本，樹立“以病人為中心”的理念，圍繞“服務、質量、安全、費用”的醫院管理年目標，不斷提高醫療質量，改善服務態度，吸收并開展新技術、新方法，在各類口腔疾病的臨床診斷、治療、科研等方面均居全省領先水平。

醫院注重保障醫療安全，建立完善的消毒隔離機制，堅持院感監控和管理，規范高溫滅菌消毒程序，堅持診治患者“一人一機”，有效杜絕醫源性感染。

醫院作為福建醫科大學口腔醫學院的直屬教學醫院和臨床教學基地，承擔為福建省培養高級口腔醫學人才的任務。現有口腔基礎醫學、牙體牙髓病學、牙周病學、口腔黏膜病學、兒童口腔醫學、預防口腔醫學、口腔頜面外科學、口腔修復學、口腔正畸學9個教研室，福建省口腔醫學實驗教學中心和福建省高校口腔醫學重點實驗室。現為口腔臨床醫學博士學位授權單位，以及口腔醫學一級學科碩士點授權單位，現有博士生導師4人、碩士生導師22人，福建醫科大學學科帶頭人5人、青年骨干教師11人。同時，每年招收本科生100多人(含港澳臺生10余人)、博、碩士研究生40多人。

醫院在口腔醫學的科學研究方面不斷取得新進展。近年來，醫院獲國家自然科學基金資助項目、福建省重大科研項目等多項國家級、省部級、廳市級科研課題，獲省科學技術獎二等獎3項、三等獎2項，省衛生廳科技進步獎3項，以及省青年科技獎、省運盛青年科技獎等。

醫院注重對外交流與合作。在福建醫科大學的支持下，聘請國內外口腔醫學界知名專家為兼職或客座教授，與國內外口腔學術界保持密切聯系，注重口腔醫學最新發展成果的學習應用，不斷擴大醫院的影響。

醫院現為福建省口腔醫學會和福建省牙病防治中心的掛靠單位，是福建省執業醫師(口腔類別)技能考試基地、福建省口腔臨床住院醫師規范化培訓基地。我院口腔全科、口腔內科、口腔頜面外科、口腔修復科和口腔正畸科5個專業成為首批國家住院醫師規范化培訓基地。

醫院不斷深入開展精神文明創建活動，加強職業道德建設，先后獲評福建省先進教工小家，省級和省直級“青年文明號”、省“五一先鋒崗”、福建醫科大學**基層黨組織等榮譽稱號。