1.常規檢查
(1)血常規：外周血象白細胞和中性粒細胞增高。
(2)痰液涂片革蘭染色：發現大量革蘭陰性桿菌。
(3)血氣分析：重癥病人PaO2可降低。部分病人特別原有慢阻肺病者PaCO2可升高，并可有不同程度的酸堿失衡。
(4)血液生化檢查：在敗血癥時如有肝、腎受損，可出現轉氨酶、BUN、Cr升高。
2.病原學檢查
(1)血培養：在摩根菌肺炎伴有菌血癥或敗血癥時，血培養有摩根菌生長。一般血源性摩根菌肺炎血培養陽性率高。但近年來發現摩根菌在應用抗生素后也有L-型細菌改變，常規血培養為陰性。應引起注意。
(2)痰液培養：此法簡單、方便，病人易接受。但易受咽部細菌污染。一般認為要留取病人肺深部咳出的痰，并于清洗和勻化定量檢查后培養，可大大提高準確性。
(3)直接采集下呼吸道分泌物培養：此法有一定創傷性，且需要一定條件，但對摩根摩根菌肺炎，特別是醫院獲得性肺炎的診斷有幫助。因避免或減少了上呼吸道細菌污染，較準確。臨床上可根據不同方法的優缺點，醫院設備及醫生技術水平，選用下列一種方法獲得下呼吸道分泌物。
①經環甲膜穿刺：插入無菌細塑料導管抽吸下呼吸道分泌物。優點是減少了咽部細菌污染，但有一定的創傷性。
②在X線胸透定位下，經胸壁穿刺抽吸肺炎病灶部位的肺組織及分泌物培養。陽性率高且完全避免了上呼吸道細菌污染。但創傷性較大。
③經纖維支氣管鏡采取下呼吸道分泌物：此法較安全，并可在直視下采取病灶部位的標本，但需一定設備。
(4)其他體液培養中段尿細菌培養計數骨髓細菌培養胸水、尿、骨髓或傷口分泌物培養。
摩根菌肺炎，經上述不同方法的病原體培養，可發現摩根菌。對于混合感染者，特別是繼發性肺炎者，還可培養出其他革蘭陽性或陰性菌。同時對培養陽性者應做藥敏試驗，為治療提供依據。
胸部X線表現為肺葉、段致密陰影、實變，可形成多發性肺膿腫。部分病人為支氣管肺炎表現。一般胸腔積液較少發生。
