本病應與其他腸寄生蟲病及其他原因引起的嗜酸性肺炎相鑒別，與鉤蟲病、潰瘍病、阿米巴病等鑒別。與其他腸寄生蟲病、鉤蟲病、阿米巴病(阿米巴原蟲引起)可通過病原學檢查進行病原形態比對做出鑒別。引起嗜酸性肺炎的病因較多，寄生蟲、真菌、藥物、化學過敏物質等都可引起，可結合病發史、病原檢查來做出鑒別;對于潰瘍病常見的是胃酸過多引起胃潰瘍或十二子腸潰瘍，此類潰瘍常出現上腹痛、噯氣、反酸。十二指腸潰瘍疼痛多在餐后2-3小時出現。根據臨床癥狀可區分類圓線蟲病與上述潰瘍病。
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