新生兒肝炎所致風(fēng)疹或巨細(xì)胞病毒有可能發(fā)展為一種腦感染，可能導(dǎo)致智力遲鈍或腦癱。
這些嬰兒當(dāng)中的許多也將因?yàn)楦尾∑茐囊鹩谰眯缘母渭?xì)胞損傷，導(dǎo)致疤痕(肝硬化)。
多數(shù)嬰兒巨細(xì)胞病毒性肝炎將會(huì)痊愈，很少或者根本沒(méi)有疤痕。對(duì)肝臟來(lái)說(shuō)，隨著膽汁流動(dòng)的改善，它的成長(zhǎng)也會(huì)逐漸正常。然而，大約20%的嬰兒因?yàn)槭艿礁窝椎挠绊懀瑢⒗^續(xù)以發(fā)展為慢性(進(jìn)行性)肝病和肝硬化。這些兒童的肝臟將會(huì)因?yàn)榘毯鄱冇玻伊鶄€(gè)月以下大的嬰兒的黃疸會(huì)不消退，最終符合這些癥狀的嬰兒將需要進(jìn)行肝臟移植。
小兒慢性肝炎新生兒由于缺乏膽汁將無(wú)法消化脂肪，吸收脂溶性維生素(A，D和E及K)，并且伴有肝細(xì)胞損傷。缺乏維生素D會(huì)導(dǎo)致骨質(zhì)疏松與軟骨發(fā)育不良(佝僂病)。缺乏維生素A會(huì)影響正常生長(zhǎng)和視力。維生素K缺乏會(huì)有易青紫及出血傾向，而缺乏維生素E會(huì)導(dǎo)致嬰兒協(xié)調(diào)性變差。由于膽汁負(fù)責(zé)消除在體內(nèi)的許多毒素，所以新生兒慢性肝炎也有可能導(dǎo)致血液中積聚毒素，從而導(dǎo)致瘙癢，皮疹和過(guò)敏。
亦可并發(fā)肝昏迷、高膽紅素血癥、低鈣性抽搐、出血、腹瀉、干眼病等疾病。
